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MOE中对接口袋的确定方式及小分子数据库的建立 - 知乎
本内容主要介绍在MOE进行对接时如何确定对接口袋与如何建立小分子数据库。
moe----- 活性口袋的确定_哔哩哔哩_bilibili
moe--活性口袋的确定主要是 1 找需要对接的小分子的蛋白-配体中配体结构类似的蛋白的活性口袋; 2 软件计算 compute site finder,结合评分,口袋的空间大小和疏水表面;
蛋白对接_MOE的基本使用(1)—小分子与蛋白质的对接 . . .
“ MOE的基本使用 (1)—小分子与蛋白质的对接 ” 院里的同学经常会问我一些MOE的使用,为了方便大家学习,在此我分享一下这个软件的基本使用方法。
计算机辅助药物设计的基础操作(MOE) - 知乎
蛋白建模和生物信息学:MOE平台中经过 CASP 验证的蛋白质同源建模功能强大且直观易用。 无论是普通蛋白还是抗体,单体或多聚体的模建都能在MOE中快速精确的完成模建。 通过清晰的三维视图可以直观地看到蛋白质内部的相互作用,也可以绘制出蛋白表面的性质。
蛋白质口袋定位与分子对接策略 - 简书
排除容积过小的口袋:在查看预测口袋时,注意排除容积过小的口袋,因为它们可能不是真正的结合位点。 观察口袋形状:将蛋白表面显示出来,观察口袋形状是否与目标分子在形状上吻合。
MOE中对接口袋的确定方式及小分子数据库的建立_百度知道
在MOE中进行对接操作需要确定活性口袋和建立小分子数据库。 活性口袋的确定有三种方式:已解析的蛋白质受体口袋,通过文献查找定位氨基酸残基设为口袋,使用MOE的Site finder功能结合分析确定。
MOE绘制2D图+口袋图_哔哩哔哩_bilibili
MOE绘制2D图+口袋图, 视频播放量 1997、弹幕量 0、点赞数 61、投硬币枚数 10、收藏人数 126、转发人数 4, 视频作者 科研小猪莹, 作者简介 分子模拟,AI蛋白设计与机器学习,蛋白质工程,AI for bio ,图文同名公众号,计算--课程 胃=keyanzhu333,相关视频:蛋白
不得不说,关于分子对接,MOE有点牛!_moe软件-CSDN博客
MOE软件的操作界面具有功能丰富的三维渲染区域,可以对配体小分子、受体蛋白及其结合口袋进行直观模拟。
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