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什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
ATAC思路：通过Tn5转座酶（在染色质开放区域各种切割，形成复合物后插入到靶序列）来富集开放染色质的DNA序列，PCR扩增后NGS测序。官方一点的话：DNA转座，是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象，由DNA转座酶来实现。
什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
康测科技为本研究提供ATAC-seq和LncRNA-seq技术服务。通过对20对前列腺癌和邻近正常前列腺组织进行ATAC-seq来分析前列腺肿瘤发生中的染色质可及性变化。
atac-seq和chip-seq的区别？ - 知乎
ATAC-seq 分析流程（from Novogene）与其他常用技术的比较： ChIP-seq：直接检测与转录因子结合的DNA序列，但一次测序只能提供一个转录因子的信息，检出率相对较低。 DNase-seq：利用DNaseI优先切割核小体被取代的DNA序列，对切割的片段进行测序，来检测特定转录因子的结合位点，但该技术对细胞起始量
分析单细胞atac数据比较全面的工具是只有archar和signac麽？ - 知乎
引言在本教学指南中，我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞（PBMCs）的单细胞ATAC-seq数据集。加载包首先加载 Signac、Seurat 和我们将用于分析人类数据的其他一些包。
已知某个转录因子，如何确定或预测其可以调控的基因有哪些？ - 知乎
公共数据库： ENCODE：多细胞类型的ChIP-seq、ATAC-seq数据。 Cistrome DB：预分析的ChIP-seq数据集和工具包。 ChEA3：基于文献和实验数据的TF-靶基因关联预测。预测工具： DeepBind （深度学习预测TF结合位点）、 CisTarget （基于motif富集度排序靶基因）。三、综合分析与
scATAC-seq分析，没有fragememts文件该咋办？ - 知乎
求助各位大佬，最近在尝试学signac包单细胞ATAC分析，但是拿到的数据只有计数矩阵csv文件，没有fragements文件，这种情况该怎么办？
想要做单细胞测序，包括RNA-seq，CHIP-seq，ATAC-seq,Hi-c，求推荐的公司？ - 知乎
康测科技为本研究提供UMI RNA-seq和ATAC-seq技术服务。为了阐明BRD4抑制诱导的红细胞分化机制，研究首先对DMSO和BRD4抑制剂处理的成红细胞进行RNA-seq和ATAC-seq。
【单细胞测序】如何用marker基因气泡图做细胞类型鉴定？ - 知乎
结合单细胞 ATAC-seq 数据，气泡图中高表达基因的气泡位置可与染色质开放区域的细胞群分布相互印证。总结 marker 基因气泡图通过多维度可视化基因在不同细胞群中的表达特征，为细胞类型注释提供量化证据，为 marker 基因筛选提供高效手段。