ATAC-seq Data Standards and Processing Pipeline - ENCODE,Business Directories,Company Directories

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什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
ATAC思路：通过Tn5转座酶（在染色质开放区域各种切割，形成复合物后插入到靶序列）来富集开放染色质的DNA序列，PCR扩增后NGS测序。官方一点的话：DNA转座，是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象，由DNA转座酶来实现。
什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
康测科技为本研究提供ATAC-seq和LncRNA-seq技术服务。通过对20对前列腺癌和邻近正常前列腺组织进行ATAC-seq来分析前列腺肿瘤发生中的染色质可及性变化。
什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) 是分子生物学中用于评估全基因组染色质可及性的技术。 2 2 如何理解ATAC-seq
atac-seq和chip-seq的区别？ - 知乎
ATAC-seq 分析流程（from Novogene）与其他常用技术的比较： ChIP-seq：直接检测与转录因子结合的DNA序列，但一次测序只能提供一个转录因子的信息，检出率相对较低。 DNase-seq：利用DNaseI优先切割核小体被取代的DNA序列，对切割的片段进行测序，来检测特定转录因子的结合位点，但该技术对细胞起始量
ATAC 或 chip-seq中peak 图，下方基因位置中方框、箭头代表什么意思？ - 知乎
康测科技为本研究提供ATAC-seq，ChIP-seq和UMI lncRNA-seq技术服务。该研究将每个组织阶段中ATAC-seq与H3K27ac信号进行重叠取其交集，将这个交集区域定义为高置信度的活性顺式调控元件，它们同时具备“开放”和“活跃”的表观遗传标记。
分析单细胞atac数据比较全面的工具是只有archar和signac麽？ - 知乎
单细胞ATAC-seq基于10x Genomics Chromium平台，将高通量单细胞捕获与ATAC-seq技术完美结合。技术原理：核心是利用工程化改造的 Tn5转座酶。该酶能特异性地识别并切割基因组中的开放染色质区域，同时在切割位点直接插入测序接头。
这种热图怎么看啊，求大神们解惑？ - 知乎
就是不同条件下，相关修饰和染色质开放程度 (atac-seq)的水平比较。每一个柱子 (不知道是不是恰当)的一条横线表示一个基因，中间表示TSS，颜色表示read映射到该位置的强度。
scATAC-seq分析，没有fragememts文件该咋办？ - 知乎
求助各位大佬，最近在尝试学signac包单细胞ATAC分析，但是拿到的数据只有计数矩阵csv文件，没有fragements文件，这种情况该怎么办？