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- TCMBank：最大的中药数据库介绍
图2 STTT文章页面 TCMBank是目前（发表文章时）规模最大、可免费下载的非商业中医药数据库。 TCMBank以mol2格式提供草药成分的3D结构，并提供与外部公共数据库的交叉引用链接，如CAS、DrugBank、PubChem、MeSH、OMIM、DO、ETCM、HERB等。
- DrugBank数据库Downloads详解（版本5. 1. 4，2019-7-2）
可以发现这是一个被批准的药物（Approved drug），是蛋白质类型。 因此，Drug Sequences是 蛋白质类药物。 2 Protein identifiers（Approved） Protein identifiers include external IDs to resources such as UniProt and PDB These downloads are divided first by protein compound type (target, transporter, etc ) Secondly they are divided by drug group (approved
- 【知识讲解】分子生物学常用网站介绍 - DXY. cn
lUniprot UniProt整合了Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三个数据库，主要优势在于添加了蛋白功能注释信息。 具有更新速度快、与其他数据库联系密切、分析工具齐全、使用便捷的特点，成为了目前信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。
- 【生信实操】一文教会你查找基因的启动子以及预测转录因子 . . .
前面我们介绍了可以帮助我们确定基因在何时、何地、何种条件下被激活的启动子，接下来我们来聊一下另一个同样重要的物质：🔑 转录因子。按照惯例，我们先来梳理一下概念：👇 转录因子Transcription Factors，TFs 转录因子能特异性地与基因的特定序列结合，通常长度在5至20bp之间，从而确保目标
- 中药研究怎么做？多靶点药物分子研究，网络药理学也能发 . . .
随后利用UniProt数据库对所有靶点进行组合和鉴定，剔除重复的验证靶点和预测靶点。 最后通过Cytoscape软件构建活性成分靶点网络。 PubChem 有机小分子生物活性数据库 https: pubchem ncbi nlm nih gov （Kim et al, 2016） STITCH 化合物-蛋白相互作用数据库
- 紧急求助：生物数据库的编号对应 - DXY. cn
最近研究人类蛋白质，用到HPRD，DIP，Inparanoid, gene ontology 这些数据库用到了不同的编号系统，如entrezgene,gi,uniprot,IPI 这些号码通过什么数据库可以查到它们的对应关系啊？ 我找了很久都没找到一个合适的数据库。 有说在uniprot有这些编号对应关系的，但是我没找到啊。 麻烦哪位知道的 能帮忙 谢谢了。
- 如何比对一个基因在不同物种间的同源性
如何比对一个基因在不同物种间的同源性一、在NCBI-Gene分别找到人源、鼠源的LOXL2（以人源的LOXL2为例子）；二、随后进入https
- 青莲百奥「青莲干货」蛋白注释利器Uniprot的玩法！
uniprot对蛋白的注释不仅全面，还很方便，只需要知道蛋白id，只需要按照上面的教程，得到大量的注释信息。 例如，得到蛋白的生物分类，再加上蛋白在样本里面的定量信息，在进行进一步的生信分析，就能得到各种好看有用的图片。 示例图展示 Krona分型图 菌
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