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- NCBI--Primer Blast 引物特异性检测 - DXY. cn
NCBI--Primer Blast 比对步骤: 1 打开NCBI,进入Blast,网页如下: 点击上图红框标记的Primer-Blast,进入如下界面,在界面引物序列处,将正反向引物序列粘贴进去,5’-3 ’ 方向。 产物大小默认为70~1000,可以根据实际情况进行调整。 选择相应的物种和参考数据库。
- Alignment--本地blast使用详解1-数据库序列检索下载及比对
二、数据准备 NCBI用于注释的数据库,可以使用研究者自己的FASTA序列使用makeblastdb创建。 也可使用NCBI现成blast数据库,解压直接使用。 blast数据库下载地址:ftp ncbi nlm nih gov bl。 数据库信息说明网站:ncbi nlm nih gov books 。
- ncbi怎么使用? - 知乎
NCBI (National Center for Biotechnology Information),美国国家生物技术信息中心。 NCBI开发有Genbank等公共数据库,提供 Pubmed、BLAST、Entres、OMIM、Taxonomy、Structure等工具,可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析,并开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的
- NCBI使用教程2:手把手教你QPCR引物设计 - dxy. cn
在生物学研究中,我们经常使用的实验检测方案就是QPCR,那我们就离不开最为关键的引物设计。小编为大家整理如何使用NCBI来进行引物设计。Primer-Blast介绍Primer-BLAST,在线设计用
- 如何查找一个基因的同源基因? - 知乎
同源序列指两个序列具有共同的祖先。同源性是一个定性的概念,我们说两条序列是或不是同源基因。但是同源序列可以用相似性来度量,如何比对两条序列的相似性呢,我们可以通过blast来进行比对。 智慧芽Bio序列数据库收录了来自专利,文献,三方源的序列,是世界上最全的序列数据库,通过序列比对,可以快速准确地找到基因的同源序列,以人ERBB3的基因序列为例
- 请问怎样用BLAST验证miRNA的引物? - 知乎
1)你需要知道目标miRNA的精确序列,通常可以从miRBase数据库或者相关文献中获得。 2)打开打开NCBI的BLAST网页,选择“nucleotide blast”(因为miRNA是核酸序列)。 在查询框中,粘贴你设计的引物序列,可分别提交正向和反向引物进行验证。
- 如何搜索某蛋白质的同源蛋白的序列? - 知乎
1、BLAST(Basic Local Alignment Search Tool):这一工具用于寻找序列相似性,BLAST能够在一个大规模的数据库中快速找到与给定序列(查询序列)相似的序列。 2、Pfam:一个蛋白质家族数据库,包含序列的功能域信息。 3、OrthoDB:一个提供基因直系同源数据库的工具。
- 如何在NCBI上批量下载蛋白质序列? - 知乎
虽然直接提问的是NCBI,但如果你的目标是蛋白质序列,也可以利用UniProt的特性。 通过UniProt的Retrieve ID Mapping工具,将蛋白质名称或Accession号映射到UniProtID,然后下载相应的蛋白质序列。 这种方法特别适合从已知的蛋白质序列信息出发,间接实现批量下载。
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