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- GCTA | Yang Lab
About GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) is a software package initially developed to estimate the proportion of phenotypic variance explained by all genome-wide SNPs for a complex trait
- GitHub - jianyangqt gcta: GCTA software
GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) is a software package, which was initially developed to estimate the proportion of phenotypic variance explained by all genome-wide SNPs for a complex trait but has been extensively extended for many other analyses of data from genome-wide association studies (GWASs)
- 一文搞定GCTA软件的学习 - 知乎
今天有老师问我GCTA软件的操作方法,我记得之前写过一系列学习笔记,重新发一下。 前面的几节中,我们介绍了GCTA计算G矩阵,和单性状遗传力的计算,它本质上就是GBLUP的估计,但是速度快很多。
- GCTA学习4 | GCTA说明文档--功能分类及常见问题-CSDN博客
GCTA学习4 | GCTA说明文档--功能分类及常见问题 原创 已于 2022-08-09 09:31:20 修改 · 5 1k 阅读
- GCTA学习4 | GCTA说明文档--功能分类及常见问题-腾讯云开发者社区-腾讯云
GCTA是一款强大的遗传分析工具,支持遗传力、遗传相关、表型预测及GWAS分析等功能。 文档详述其使用方法、常见问题及解决方案,包括样本量要求、内存需求及遗传力估算等,助力高效遗传数据分析。
- Software | Yang Lab
GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) is a software package, which was initially developed to estimate the proportion of phenotypic variance explained by all genome-wide SNPs for a complex
- 如何用 GCTA软件进行PCA分析并进行可视化-腾讯云开发者社区-腾讯云
GCTA软件计算PCA分析教程,详解PLINK格式数据处理、GRM矩阵构建及R语言可视化方法。包含Yang和Van两种GRM算法对比,以及碎石图、主成分散点图绘制技巧,适用于GWAS种群分层校正和大样本遗传数据分析。
- 基于GCTA做GWAS分析并计算遗传力 - 知乎
之前一直使用的Emmax做GWAS分析,但Emmax输出的 ps文件的信息相对较少,隔壁课题组师兄推荐使用GCTA做GWAS。 OK,听劝! snp相关的分析软件例如vcftools、plink、GCTA等参数都非常相似。 0 GCTA官网各类版本、参数均…
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