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- 常用microRNA靶基因预测工具 - 知乎
RNA22与miRDB类似，能预测miRNA的靶基因，预测mRNA、LincRNA、LncRNA的候选作用miRNA（RNA22 visualization tool ）。 此外，其在线预测特定基因序列和特定miRNA序列的作用位点的功能强大（RNA22 dynamic prediction tool）。
- miRDB - MicroRNA Target Prediction Database
Common features associated with miRNA binding and target downregulation have been identified and used to predict miRNA targets with machine learning methods miRDB hosts predicted miRNA targets in five species: human, mouse, rat, dog and chicken
- 干货|手把手教你如何使用TargetScan预测miRNA的靶基因
miRNA是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA，其大小长约19~25个核苷酸单链小分子RNA，经典的功能包括：（1） 翻译抑制：miRNA与靶mRNA通过6-7个碱基互补结合，可导致miRNA在蛋白质翻译水平上抑制靶基因表达。
- 经典的miRNA靶标预测数据库 - 知乎
miRNA-Target 预测miRNA的靶基因。 该模块提供miRNA-mRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-pseudogene、miRNA-circRNA和miRNA-sncRNA的相互作用网络，这里我们以miRNA-mRNA为例，展示如何根据特定的miRNA预测与其结合的mRNA，具体操作如下图所示。 以hsa-let-7a-5p为例，通过左侧面板进行具体设置。
- 输入序列就可以预测 - 在线版miRanda靶基因预测来了_miranda数据库-CSDN博客
本文介绍了微生信平台推出的在线版miRanda，用于miRNA靶基因预测。 用户可以方便地输入fasta格式的miRNA和mRNA（或lncRNA、circRNA）序列，设置参数后进行预测。 预测结果包括miRNA-mRNA对、结合位点等信息。 建议结合多个软件结果进行靶基因筛选。
- 如何预测和鉴定miRNA的靶基因？ - 知乎
通过qPCR或新一代测序分析分离出的RNA，鉴定出特定miRNA的靶标mRNA。 Sigma-Aldrich的MISSION Target ID cDNA文库让研究人员能够在实验室内开展全转录组范围的miRNA和ncRNA靶基因鉴定。
- miRDB和TargetScan预测miRNA的靶基因结果得分可靠吗？ - 知乎
miRDB和TargetScan是两个广泛使用的在线数据库，用于预测microRNA (miRNA)的靶基因。 这两个工具使用不同的算法和生物信息学方法来预测miRNA与其潜在靶基因之间的相互作用。 • miRDB：这个数据库利用一个机器学习方法，基于大量的实验数据来预测miRNA的靶标。
- 微生信-miRanda在线预测miRNA-mRNA，miRNA-circRNA，miRNA-lncRNA结合
miRanda在线预测miRNA靶基因 简介 miRanda是一种检测基因组序列中miRNA潜在靶位点的算法。 当前版本：v3 3a miRanda is an algorithm for the detection of potential microRNA target sites in genomic sequences 两步策略：1，在查询的miRNA序列和mRNA 3'UTR序列间进行动态规划局部比对。
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