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- scaffold 在基因中是什么? 希望能清楚点解释 - 知乎
scaffold 其实是基因组组装时的概念。涉及到的相关概念如下： reads：就是我们测序产生的短读序列，通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间，二代的相对较短，平均是几十到几百bp。 contig：中文叫做重叠群，就是不同reads之间的overlap交叠区，拼接成的序列就是contig scaffold: 是比contig还要长的
- 常见的Cas12a酶类它们的crRNA的直接重复序列（又名DR区或Scaffold区）序列有什么不同？ - 知乎
关于Cas12a crRNA的直接重复序列（DR区或Scaffold区）的具体序列，这个信息可以因物种来源的Cas12a酶而异。 通常，DR序列是crRNA中高度保守的部分，它在生物体的CRISPR阵列中重复出现，分隔每个spacer序列。
- 如何设计crisper-dcas9系统的gRNA，具体步骤是什么？ - 知乎
tracrRNA（在CRISPR-Cas9编辑技术中被优化并命名为gRNA scaffold），它负责与Cas9结合，与重复序列具有同源性。 crRNA为引导序列，约20个碱基，具有特异性。
- 如何oku? - 知乎
scaffold直接翻译过来是脚手架。 这个概念和“测末端”有关。 简单地说，你测序的时候筛选到了20kb长的片段，但是一代和二代都测不通，只能测两端很短的序列。 这时候你有了这个20kb的片段两端的序列，以及这两段序列之间的距离（20k）。
- CRISPR Cas9系统中的crRNA和tracrRNA是什么？ - 知乎
crRNA是 CRISPR RNA 的简写，tracrRNA是 trans-activating crRNA 的简写。crRNA以前体pre-crRNA的形式被转录，tracrRNA单独转录，tracrRNA和pre-crRNA通过碱基配对作用结合，经过 RNaseIII 修剪，并与 Cas9 结合，成为具有DNA切割能力的复合体。 现在人工改造的版本中tracrRNA和crRNA被整合成了一个RNA转录出来，通过碱基配对
- cas12a的crRNA该怎么去设计与寻找？ - 知乎
最近Marraffini团队发表在MC上发表的一篇文献介绍了如何设计高效的Cas13a-crRNA（marraffini rockefeller edu）值得我们去学习应用，大家如果有在做Cas13a检测的可以点进去学习一下。 目前对于Cas12a的检测DNA应用较多，今天主要是和大家一起学习一下如何设计高效Cas12a-crRNA引物。下文是发表在nature期刊上的一篇
- 如何理解泛基因组学中的从头组装法？ - 知乎
"Scaffolding contigs" 是生物信息学和基因组学领域中的专业术语，用于描述基因组组装过程中的一种步骤。在基因组组装中，最初的结果通常是一组短的连续序列片段，这些片段称为 contigs。为了进一步提高组装的连续性，填补重复的区域和间隙，研究人员使用 scaffolding 过程来组装这些 contigs 成为更长
- 编程中的脚手架是什么意思？ - 知乎
The compiler uses this specification to generate code that the application can use to create, read, update and delete database entries, effectively treating the template as a "scaffold" on which to build a more powerful application 翻译过来就是： “脚手架”是一种元编程的方法，用于构建基于数据库的应用。
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