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  • 想请教一下基因组SNP分析基本方法和流程是? - 知乎
    SNP下游分析 | 利用VCF文件进行构建系统进化树 在之前的一篇推文中,我们学会了如何使用GATK软件对测序数据(基因组测序和转录组测序均可)进行变异分析(SNP、InDel),同时提取出可靠的变异位点。
  • SNP (单核苷酸多态性)这个现象在生物领域可以用作什么研究,能够解决那些问题? - 知乎
    SNP(单核苷酸多态性)是生物领域中常见的遗传变异类型,指的是基因组中单个核苷酸(A、T、C、G)的变异。SNP的存在可以用于各种研究,并且可以解决许多问题,包括: 遗传疾病研究:SNP与遗传疾病之间存在相关性。通过研究SNP的分布和频率,可以了解某些遗传疾病的患病风险和相关基因。 种群
  • SNP单核苷酸多态性跟点突变有什么区别? - 知乎
    SNP是单碱基多态性,是一个群体概念,这个差异占群体的1%以上。 若 germline mutation频率<1%,我们认为是一个点突变。 SNP是各种生物都有的,通过同源基因比对得到的,一般不会发生变化,而点突变只对单一基因而言,所以从数量上SNP比点突变多得多。
  • 能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀,如何理解呢?
    2, SNP位置不一定在gene上,可能在基因之外的区域,也会有作用。 3, 基因型(T,A,G)不一定是来自父母,可能会自发突变,和爹妈都不一样。 rs编号里不一定包括了所有的突变类型,甚至数据库里rs编号是有版本属性的,会更新,核对的时候要小心。
  • 基因、染色体、位点、SNP 位点,都是什么,它们之间有什么关系? - 知乎
    基因、染色体、位点、SNP 位点,都是什么,它们之间有什么关系? 看到23 me,感觉很好奇,于是搜索了很多文章,想知道个人基因检测是怎么玩儿的。
  • 遗传学中什么是SNP什么是单倍型,他们俩有什么关系? - 知乎
    SNP :是指基因组上由 单个核苷酸 的变异所引起的DNA序列 多态性。 如图: 单倍型:单倍型 (haplotype):位于一条染色体上某一区域的一组相关联的多个SNP等位位点被称作单倍型。 单倍型表示以基因*数字或数字字母组合表示,如 CYP2C9 *1, CYP2C9 *,如图:
  • 如何通过snp位点找到候选基因? - 知乎
    一般而言,SNP定位到目标基因,需要到的文件有SNP坐标信息(例如 vcf),基因功能注释信息(一般参考基因组的就行,既基因所对应的kegg或者go注释与编号),基因组注释信息(包含基因在染色体上的位置坐标,一般为 gff, gtf或者 gff3)。
  • SNP(单核苷酸多态性)的起源是什么? - 知乎
    SNP(Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,这一概念首次出现于1994年发表的人类分子遗传杂志上,随后于1996年由美国麻省理工的Lander正式提出并认定其为“第三代分子标记”,是对以往“限制性酶切片段长度多态性”和“微卫星标记”两代分子标记的




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