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- scaffold 在基因中是什么? 希望能清楚点解释 - 知乎
scaffold 其实是基因组组装时的概念。涉及到的相关概念如下： reads：就是我们测序产生的短读序列，通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间，二代的相对较短，平均是几十到几百bp。 contig：中文叫做重叠群，就是不同reads之间的overlap交叠区，拼接成的序列就是contig scaffold: 是比contig还要长的
- 如何oku? - 知乎
scaffold直接翻译过来是脚手架。 这个概念和“测末端”有关。 简单地说，你测序的时候筛选到了20kb长的片段，但是一代和二代都测不通，只能测两端很短的序列。 这时候你有了这个20kb的片段两端的序列，以及这两段序列之间的距离（20k）。
- 如何设计crisper-dcas9系统的gRNA，具体步骤是什么？ - 知乎
tracrRNA（在CRISPR-Cas9编辑技术中被优化并命名为gRNA scaffold），它负责与Cas9结合，与重复序列具有同源性。 crRNA为引导序列，约20个碱基，具有特异性。
- 如何将sgRNA和sgRNA scaffold连接到cas9载体上? - 知乎
SgRNA scaffold设计:sgRNA scaffold是一个特定的RNA结构，它与SGRNA结合并促进Cas9蛋白的切劃活性通常，sgRNA scaffold的序列是已知的，并且可以在许多载体中找到。 2 准备Cas9载体 获取包含Cas9蛋白表达框的载体，这个载体可以是商业化的，也可以是实验室内部构建的。
- 常见的Cas12a酶类它们的crRNA的直接重复序列（又名DR区或Scaffold区）序列有什么不同？ - 知乎
关于Cas12a crRNA的直接重复序列（DR区或Scaffold区）的具体序列，这个信息可以因物种来源的Cas12a酶而异。 通常，DR序列是crRNA中高度保守的部分，它在生物体的CRISPR阵列中重复出现，分隔每个spacer序列。
- 截止 2022 年，联邦学习有哪些成熟的框架或惊艳的应用？ - 知乎
SCAFFOLD: Stochastic Controlled Averaging for On-Device Federated Learning Improving Federated Learning Personalization via Model Agnostic Meta Learning (NIPS 2019 Workshop) Personalized Federated Learning with First Order Model Optimization (ICLR 2021) LoAdaBoost: Loss-Based AdaBoost Federated Machine Learning on Medical Data
- 二代测序组装完整基因组，有映射比对组装 (mapping assembly)软件推荐吗？ - 知乎
在基因组组装领域，映射比对组装（mapping assembly）通常不是直接用于生成完整基因组序列的主要方法，而是用来辅助校正或完善从头组装的结果。不过，对于基因组分析，特别是利用已有的参考基因组进行变异检测、注释等，映射比对是非常关键的步骤。常用的映射软件包括： BWA (Burrows-Wheeler Aligner
- cas12a的crRNA该怎么去设计与寻找？ - 知乎
比如我想去检测hpv，我现在该如果去设计我的crRNA?有偿！我真的不想再一个人鬼打墙了！
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