ACTIWORK S.R.L.Business Directories,Company Directories

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GEO入门教程 | 如何利用GEO数据库筛选适合自己的数据集 . . .
02 GEO数据库中数据的四个层级 GEO数据库中的数据有四个层级，搞懂什么是 GPL，GSE，GDS 和 GSM ，也就搞懂了如何进行检索。我们都知道，GEO这种大型数据库收录的数据又多又杂，在存放时就必然不能乱七八糟地存放，不然检索起来就会十分困难。
零基础入门转录组下游分析——数据处理（GEO数据库 . . .
GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。
单细胞公共数据集怎么下载？ - 知乎
数据平台，跟bulk seq常说的GPLxxx一致，例如GPL21103；数据储存格式，只有一个RAW，还是有count等数据。前两种需要结合到具体数据集中，我们后续才涉及到，今天我们先根据数据储存格式说说如何下载数据。首先我们需要进入GEO数据库，在网站打入
请问怎么从GEO数据库里面下载样本的临床信息啊？比如 . . .
公共数据库数据的预后分析一般除了 TCGA 之外，GEO 的出镜率也非常高。但是 GEO 数据库中的数据比较混乱，找数据需要花不少时间。另外 GEO 上的临床数据也不太好找，看到不少小伙伴都在问这个问题。笔者就把一周以来查到的资料，整理亲测后分享
RNA-seq数据只有处理后的数据，能上传GEO数据库吗？ - 知乎
文章要求测序数据上传数据库，想上传GEO数据库但是原始数据fastq文件找不着了，只有公司给的处理过的转成Count的数据，请问还能上传GEO数据库吗… 显示全部
GEO数据库找差异基因？ - 知乎
GEO数据库是最大的公共数据库之一，包含有多种平台的数据，包括常见的芯片数据、高通量数据（RNAseq、ChIP、单细胞测序数据等等）。由于是开放给作者上传高通量数据，所以即便是同一个平台（或者同一个GPL平台号）的数据中，包含的数据情况也是各式各样的，也可能会存在有数据缺失的情况。
GEO数据集挖数据有啥经验？ - 知乎
数据库概览 GEOexplorer数据库（ https: geoexplorer rosalind kcl ac uk ）于2022年5月份发布在Nucleic Acids Research杂志，基于GEO数据库芯片和RNA-seq数据或者上传个人数据集，提供探索性数据集分析、基因表达差异分析和功能注释及可视化等功能，产生丰富的交互式可视化结果，无需要编程即可产出发表级图表
GEO数据库没有提供注释文件该如何进行基因注释？（如 . . .
GEO（Gene Expression Omnibus）数据库主要存储基因表达和其他分子profilings数据，包括微阵列、RNA-seq、ChIP-seq等。当您需要对特定平台的数据进行基因注释，但GEO未直接提供注释文件时（例如针对GPL21697平台），您可以遵循以下步骤进行基因注释：
这些医学公开数据库，你们都知道吗？ - DXY. cn
大数据挖掘是现在的时代潮流，我们医学类研究现在也讲究大数据，之前很多人利用过公开的数据库来发表论文，比如GEO数据库，TCGA数据库等等，这些都属于公开的数据库。今天主要就跟大家分享一些其他的与我们医学相关的国内外数据库： 1
从GEO上搜索到不同平台的基因芯片，如何将不同平台进行 . . .
很久以前纯粹为了玩拖过GEO里面转录组芯片的数据。大概900多个把。首先有的数据是做了log转换的有的没有。是否做了转换，在数据文件里面是有一个entry进行描述的。但是描述的五花八门，有的是lg2 有的是log transformed，等等不一而同。